Penyakit mata herediter (inherited eye disease) adalah sekelompok penyakit yang memengaruhi berbagai struktur mata seperti retina, saraf optik, kornea, dan lensa, yang sebagian besar disebabkan oleh mutasi gen. Tes genetik sangat penting untuk diagnosis pasti, identifikasi pola pewarisan, dan penyediaan informasi bagi pasien dan keluarga, sehingga peran dokter mata sangat besar.
Hubungan antara varian dan penyakit belum terbukti
VUS memerlukan interpretasi dan evaluasi lebih lanjut oleh ahli, dan tidak dapat digunakan sebagai dasar diagnosis.
QApa yang terjadi jika hasil tes genetik menunjukkan "varian yang tidak jelas signifikansinya (VUS)"?
A
VUS adalah hasil yang hubungan antara mutasi dan penyakitnya saat ini tidak diketahui, dan tidak dapat dipastikan sebagai “positif” maupun “negatif”. Interpretasi oleh konselor genetik profesional atau spesialis genetika mata diperlukan, dan dapat diklasifikasikan ulang melalui pembaruan basis data atau pemeriksaan keluarga tambahan.
Dalam diagnosis penyakit mata herediter, disarankan untuk melakukan pemeriksaan secara bertahap dengan urutan sebagai berikut. 1)
Pemeriksaan panel gen: Mengevaluasi beberapa gen yang spesifik untuk kelompok penyakit yang dicurigai secara bersamaan. Memiliki keseimbangan yang baik antara biaya dan efisiensi analisis.
Whole Exome Sequencing (WES): Dilakukan jika pemeriksaan panel tidak mencapai diagnosis. Analisis trio (pasien + kedua orang tua) meningkatkan akurasi interpretasi varian.
Whole Genome Sequencing (WGS) : Dilakukan jika WES tidak dapat mendiagnosis. Dapat mendeteksi mutasi di daerah non-kode seperti intron dan daerah promotor.
Jika pendekatan bertahap panel→WES→WGS tidak memberikan diagnosis, metode komplementer seperti RNA-seq, sekuensing untai panjang, dan uji fungsional dapat dipertimbangkan. 1)
Analisis ulang data eksom dan genom secara berkala dapat mendeteksi varian penyebab yang tidak teridentifikasi pada analisis awal, dengan laporan peningkatan tingkat diagnosis hingga 20%. 1)
QApa perbedaan antara whole exome sequencing dan whole genome sequencing?
A
WES menargetkan daerah eksom yang mengkode protein (sekitar 1-2% dari seluruh genom) dan biayanya relatif rendah. WGS menganalisis seluruh genom termasuk intron, promotor, dan daerah regulasi, sehingga dapat mendeteksi mutasi pada daerah non-kode, namun biaya dan volume data lebih besar.
QDalam urutan apa tes genetik dilakukan?
A
Umumnya pendekatan bertahap direkomendasikan: panel tes → WES → WGS. 1) Pertama, gen terkait dari kelompok penyakit yang dicurigai dievaluasi dengan panel tes, dan jika diagnosis tidak tercapai, dilanjutkan ke WES. Jika masih sulit didiagnosis, WGS dipertimbangkan.
Database berikut digunakan untuk menentukan signifikansi klinis dari mutasi. 1)
RetNet: Database komprehensif gen terkait penyakit mata. Berisi korespondensi antara gen penyakit yang ditemukan dan fenotipe.
ClinVar: Database NCBI yang mengumpulkan hubungan antara varian genetik dan penyakit sebagai data publik.
LOVD (Leiden Open Variation Database): Database terbuka yang mengumpulkan informasi varian per gen. Dapat mencari informasi varian yang dibagikan oleh peneliti dan klinisi.
7. Penelitian Terbaru dan Prospek ke Depan (Laporan Tahap Penelitian)
voretigene neparvovec (Luxturna): Obat terapi gen oftalmologi pertama yang disetujui oleh FDA dan EMA pada tahun 2017 untuk distrofi retina herediter (LCA2) akibat mutasi gen RPE65. 1) Diberikan melalui injeksi subretina menggunakan vektor AAV.
Efek pada kohort anak: Pada terapi gen AAV (Fase III) untuk Choroideremia (mutasi gen CHM), dilaporkan stabilisasi penglihatan pada kohort anak. 1)
Tahap Penelitian/Uji Klinis
Penyakit Stargardt (mutasi ABCA4): Terapi menggunakan vektor AAV ganda dan oligonukleotida antisense (ASO) sedang berlangsung dalam uji fase I/II. 1)
Achromatopsia (mutasi CNGA3/CNGB3): Terapi gen menggunakan vektor AAV sedang dievaluasi dalam uji fase I/II. 1)
Sindrom Usher 1B (mutasi MYO7A): Terapi vektor AAV ganda untuk gen besar sedang berlangsung dalam uji fase I/II. 1)
Retinoskisis terkait-X (mutasi RS1): Terapi menggunakan vektor AAV8 sedang dievaluasi dalam uji fase I/II. 1)
Dalam terapi gen oftalmologi, vektor AAV (adeno-associated virus) adalah sistem pengiriman yang paling sering digunakan. 1) Mata merupakan lokasi imunoprivilese dan memungkinkan pemberian lokal minimal invasif, sehingga menjadi organ target utama terapi gen.
QSejauh mana perkembangan terapi gen untuk penyakit mata herediter?
A
Voretigene neparvovec untuk LCA2 (amaurosis kongenital Leber akibat mutasi RPE65) telah mendapat persetujuan FDA dan EMA pada tahun 2017 dan tersedia untuk penggunaan klinis. 1)Terapi gen untuk IRD lainnya (penyakit Stargardt, akromatopsia, sindrom Usher, dll.) saat ini berada pada tahap Fase I hingga III.